El entorno socioeconómico y construido de una zona están interrelacionados con los datos sanitarios e influyen directamente en el desarrollo de los niños. Existen facilitadores y barreras para que las escuelas promuevan la actividad física dependiendo del nivel socioeconómico de la escuela. El objetivo de este estudio fue analizar la relación entre la actividad física y el sueño y el nivel socioeconómico de los niños del País Vasco. La muestra estuvo formada por 1139 escolares de entre seis y diecisiete años (566 niños y 573 niñas) de 75 colegios (43 públicos y 32 privados). Las diferencias entre grupos se compararon mediante la prueba U de Mann-Whitney (dos muestras), ANOVA de un factor de Kruskal-Wallis (k muestras) y correlación Rho de Spearman. Existen diferencias por sexo en la actividad física ligera (200,8 ± 62,5 frente a 215,9 ± 54,7) y moderada (69,0 ± 34,3 frente a 79,9 ± 32,1) a favor del grupo femenino de nivel socioeconómico más alto en comparación con el grupo masculino de nivel socioeconómico más alto. En el caso de la actividad física vigorosa, el grupo femenino realizó menos que el grupo masculino en todos los estatus socioeconómicos, lo que fue estadísticamente significativo en los grupos de estatus socioeconómico alto (11,6 ± 9,3 frente a 6,9 ± 5,7) en el grupo 2 y de estatus socioeconómico medio (11,1 ± 9,3 frente a 7,7 ± 6,1) en el grupo 3. Existe una relación inversa entre el comportamiento sedentario y el IMC, el tiempo total de cama, el tiempo total de sueño y los despertares nocturnos. También existe una relación inversa entre todos los niveles de actividad física realizada con respecto al IMC y la eficiencia total del sueño. Estos datos apuntan hacia notables desigualdades en la actividad física y el sueño diario en los escolares vascos, que a su vez pueden estar marginados en nuestro actual sistema escolar debido a los efectos del entorno socioeconómico.